据记载，朱由检入宫时的情景完全可以用小心翼翼来形容，为了防止自己像父亲朱常洛那样不明不白地死去，在入宫时他竟然自己带着干粮和饮用水。即便是到了晚上，朱由检也不敢轻易入睡，他还要仔细地监视周围的太监是否有什么异动，要知道，在这偌大的紫禁城里，魏忠贤可是布下了近万人的武装阉党！
自懂事以来一直到登基前，朱由检一直胆战心惊地活在魏忠贤的魔影下，或许是自幼生活环境的复杂与提心吊胆，直到继位之初朱由检也一直小心翼翼，也由此决定了他性格多疑，刚愎自用，驭下苛刻而寡恩。
《三垣笔记》中记载了一件事，充分暴露了崇祯的多疑：“崇祯有一天在宫里无意中听到自己最宠爱的田贵妃在独自抚琴，心中十分怀疑，便询问贵妃的琴艺师从何处，贵妃说是母亲自幼教授的。第二天，崇祯立马将贵妃的母亲召入宫中，田母与贵妃对弹，崇祯才释然作罢。”崇祯对于自己的后宫宠妃尚且如此猜忌，对于手下的朝廷重臣、封疆大吏便可想而知了。
他在位17年中，频繁更迭阁部臣僚，多次诛杀督抚大吏，其中总督有7人，巡抚有11人。内阁重臣更频繁替换，先后用了近50人，也出现了“崇祯五十相”这样一个历史名词，说的便是崇祯用人多疑，举措乖张，有恩不欲归下，有过全盘推脱。
袁崇焕一案更是崇祯自毁长城。崇祯三年，镇守边关的辽东巡抚袁崇焕被以“谋叛”大罪论死，随着刑场上的千刀万剐，大明江山也随即支离破碎。“自崇焕死，边事益无人，明亡征决矣。”
崇祯的多疑与偏执使得他对于朝臣的态度复杂多变。对身担重责的大臣，崇祯通常是先寄予极大的，甚至是超出实际的期望，一旦令其失望之后，又一变而为切齿愤恨，必杀之而后快。崇祯以唯才是用为标准，有讽刺意味的是，居然满朝无可撑局面之人。
柏杨在《中国人史纲》中调侃：“明王朝第十七任皇帝朱由检并不是不想把国家治理好，但他没有治理国家的能力，犹如小学生没有写出博士论文的能力一样。他精力充沛，沾沾自喜于自己明智的措施，发脾气的时候不可理喻，而且几乎是一天二十四小时都在发脾气。他对自己的错误永远有动听的掩饰，绝不寻求更正，却喜欢他的部下歌颂他英明。”
“高皇帝在九京，不管亡家破鼎，那知他圣子神孙，反不如漂篷断梗。十七年忧国如病，呼不应天灵祖灵，调不来亲兵救兵；白练无情，送君王一命。伤心煞煤山私幸，独殉了社稷苍生。”
这段话是孔尚任《桃花扇》中的一段唱词，是驻扎武昌的左良玉闻听京师陷落、崇祯殉国后的一番感慨。崇祯皇帝自缢时，衣襟遗言中有这样一句话：“朕自登基十七年，逆贼直逼京师，虽朕薄德貎恭，上干天咎，然皆诸臣之误朕也。”一直到死，他对诸臣的猜疑也没有消除。君主对臣下毫无信任可言，又怎能调来亲兵救兵？
